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如今愈來愈多的公司、本人都開設合伙企業(yè)，用于持倉，開設期權(quán)池等，主要是取決于合伙企業(yè)的優(yōu)點取決于防止“雙向繳稅”。針對合伙企業(yè)的一般合伙人和比較有限合伙人的繳稅了解上通常存有眾多了解上的錯誤觀念，匯總剖析以下幾個方面，供大伙兒參照：
一、合伙企業(yè)未具體利潤分配，做為合伙人的法人公司還要確認收入繳納公司所得稅
依據(jù)《財政部 國家稅務總局關(guān)于合伙企業(yè)合伙人所得稅問題的通知》（稅務總局〔2008〕159號）第二條的要求，合伙企業(yè)以每一個合伙人為繳稅扣繳義務人。合伙企業(yè)合伙人是普通合伙人的，繳納本人所得稅；合伙人是是法人和其他組織的，繳納公司所得稅。
第三條要求：“合伙企業(yè)生產(chǎn)制造經(jīng)營所得和別的所得采用“先分后稅”的標準。實際應繳稅所得額的測算依照《關(guān)于個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)投資者征收個人所得稅的規(guī)定》（稅務總局〔2000〕91號）及《財政部、國家稅務總局關(guān)于調(diào)整個體工商戶個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)個人所得稅稅前扣除標準有關(guān)問題的通知》（稅務總局〔2008〕65號）的相關(guān)要求實行。前述所稱生產(chǎn)制造經(jīng)營所得和別的所得，包含合伙企業(yè)分派給全部合伙人的所得和公司當初存留的所得（盈利）。
因而，無論合伙企業(yè)是不是作出分配利潤決策，要是其有生產(chǎn)制造經(jīng)營所得和別的所得，應當按稅務總局〔2008〕159號第四條要求，記入法人公司當初的應繳稅所得額測算繳納公司所得稅。做為法人公司的合伙人要留意這一點。
二、合伙企業(yè)虧本，合伙人不可抵扣
稅務總局〔2008〕159號《財政部國家稅務總局關(guān)于合伙企業(yè)合伙人所得稅問題的通知》第五條：合伙企業(yè)的合伙人是法人和其他組織的，合伙人在預估其繳納公司所得稅時，不可用合伙企業(yè)的虧本抵扣增值稅其贏利。
暨合伙企業(yè)若有運營虧本，而公司合伙人自身生產(chǎn)運營有贏利的，不可用合伙企業(yè)的虧本來抵減本公司的贏利。
三、法人合伙人對合伙企業(yè)權(quán)益性投資盈利不可以可用股利分配所得免稅政策要求
《企業(yè)所得稅法實施條例》第八十三條要求："滿足條件的居民企業(yè)中間的股息紅利等權(quán)益性投資盈利，就是指居民企業(yè)對外直接投資于別的居民企業(yè)獲得的長期投資"而合伙企業(yè)不屬于公司所得稅收法律要求的經(jīng)營者，也不屬于公司所得稅收法律標準的居民企業(yè)；另外，合伙企業(yè)的法人合伙人也仍未對外直接投資分派股息紅利的公司。
換句話說合伙企業(yè)對外開放股權(quán)投資分回的股息紅利按合伙協(xié)議承諾的比例分到法人合伙人時，法人合伙人獲得此所得不符免稅政策長期投資的現(xiàn)行政策要求。
但北京《關(guān)于促進股權(quán)投資基金業(yè)發(fā)展的意見》（京金融辦〔2009〕5號）要求：合伙制企業(yè)基金管理公司從被合營企業(yè)得到 的股利分配、收益等投資型盈利，歸屬于已繳納公司所得稅的稅后工資盈利，該盈利可依照合伙協(xié)議承諾立即分派給法人合伙人，其公司所得稅按相關(guān)現(xiàn)行政策實行。此乃地區(qū)性現(xiàn)行政策，實際實行仍需商議。
四、合伙人出讓合伙企業(yè)市場份額應繳稅
針對出讓合伙企業(yè)市場份額的合伙人怎樣繳稅難題實踐活動中普通合伙人合伙人出讓項目投資財產(chǎn)按“資產(chǎn)出讓所得”和20%的征收率繳納本人所得稅，法人合伙人依照出讓所得繳納所得稅，都容許抵扣資產(chǎn)固定資產(chǎn)原值和有效花費。
五、不實行合作經(jīng)營事務管理的比較有限合伙人的長期投資稅率難題
依照合伙企業(yè)法的原意，不實行合作經(jīng)營事務管理的比較有限普通合伙人合伙人，事實上是項目投資個人行為，其所得并不是經(jīng)營所得，而應該是長期投資。一般合伙人收益中歸屬于股份長期投資的一部分，應當能夠按“貸款利息、股利分配、收益所得”稅收分類可用20%稅額計算公式繳納本人所得稅。但在國家稅務總方面并沒有相近要求，還是依照經(jīng)營所得的征收率實行。但在一些地區(qū)的稅務局，也擁有些相近要求：
如：上海《關(guān)于本市股權(quán)投資企業(yè)工商登記等事項的通知》要求：不實行比較有限合伙企業(yè)合作經(jīng)營事務管理的普通合伙人比較有限合伙人，其從比較有限合伙企業(yè)獲得的股份長期投資，依照《中華人民共和國個人所得稅法》以及條例全文的要求，按“貸款利息、股利分配、收益所得”應納稅額新項目，依20%稅額計算公式繳納本人所得稅。
天津《促進股權(quán)投資基金業(yè)發(fā)展辦法》要求：以有限合伙企業(yè)方式開設的合伙制企業(yè)股份基金投資中，普通合伙人比較有限合伙人，根據(jù)相關(guān)法律法規(guī)要求，依照"貸款利息、股利分配、收益所得"或"資產(chǎn)出讓所得"新項目征繳本人所得稅，征收率可用20%;普通合伙人一般合伙人，既實行合作經(jīng)營業(yè)務流程又為股票基金的投資人的，獲得的所得能區(qū)劃清晰時，對在其中的長期投資或公司股權(quán)轉(zhuǎn)讓盈利一部分，征收率可用20%。